D. Yu. Ryazantsev، E. M. Chudinova، L. Yu. Kokaeva، S.N Elansky، P. N. Balabko، G. L. Belova، S. K. Zavriev
تسبب الفطريات الممرضة للنبات Colletotrichum coccodes أمراضًا خطيرة في البطاطس والطماطم تُعرف باسم أنثراكنوز وبقعة الدرنات السوداء. من خلال الخصائص المورفولوجية ، غالبًا ما يكون من الصعب تمييزها عن الأمراض التي تسببها الكائنات الحية الدقيقة الأخرى ؛ على ثمار الطماطم الخضراء ، يمكن أن يكون المرض بدون أعراض ، ولا يظهر إلا في الثمار الحمراء الناضجة. للتشخيص السريع والدقيق للعوامل الممرضة ، يتم تقديم نظام اختبار PCR في الوقت الفعلي. لتطوير نظام اختبار ، تم تحديد تسلسل النوكليوتيدات لجين الجلسرين ثلاثي الفوسفات ديهيدروجينيز لسلالات 45 C. coccodes المعزولة من درنات البطاطس في مناطق مختلفة من روسيا.
بناءً على النتائج التي تم الحصول عليها وتحليل التسلسلات المماثلة للأنواع الأخرى المتاحة في قاعدة بيانات GenBank ، تم تصميم بادئات خاصة بالأنواع ومسبار لـ C. coccodes. للتحقق من خصوصية نظام الاختبار الذي تم إنشاؤه ، تم إجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل باستخدام الحمض النووي المعزول من الثقافات النقية لـ 15 نوعًا مختلفًا من الفطريات الطفيلية والرائعة المرتبطة بنباتات الطماطم والبطاطس (Fusarium oxysporum و F. verticillium و Phomopsis phaseoli و Alternaria alternata و Helminthosporium solani و Colletotrichum coccodes Phellinus ferrugineovelutinus ، Stemphylium vesicarium ، Helminthosporium solani ، Phomopsis phaseoli ، Neonectria radicicola ، Rhizoctonia solani ، Penicillium sp. ، Cladosporium fulvum ، C. cladosporioides). تم تحديد وجود DNA Colletotrichum coccodes في دورة عتبة 20-27 ، بينما تم اكتشاف الأنواع الأخرى بعد 40 دورة أو لم يتم اكتشافها. يتيح نظام الاختبار إمكانية الكشف بشكل موثوق عن تراكيز الحمض النووي لـ C. coccodes التي تزيد عن 0.01 نانوغرام / مم 3 في خليط PCR الذي تم تحليله. باستخدام نظام الاختبار المتطور ، تم التحقق من وجود بكتيريا C. coccodes في أوراق الطماطم مع أعراض أمراض فطرية وفي درنات البطاطس بدون أعراض خارجية للمرض. تم جمع الأوراق التي تظهر عليها أعراض العدوى الفطرية من حقلين مختلفين في إقليم كراسنودار ، الدرنات - من حقول في مناطق كوستروما وموسكو وكالوغا ونيجني نوفغورود. تم العثور على ورقة طماطم واحدة تحتوي على الحمض النووي C. coccodes في إقليم كراسنودار. تم الكشف عن وجود كبير للحمض النووي لهذا العامل الممرض في 5 عينات من الدرنات المزروعة في مناطق كوستروما وموسكو وكالوغا.
مقدمة
تعتبر الفطريات من جنس Colletotrichum من مسببات الأمراض النباتية الخطيرة التي تؤثر على الحبوب والخضروات والأعشاب والفواكه المعمرة ونباتات التوت. أحد الأنواع المنتشرة في كل مكان لهذا الجنس ، Colletotrichum coccodes (Wallr).
Hughes ، هو العامل المسبب لأنثراكنوز والبقعة السوداء للبطاطس والطماطم ، ويسبب أمراضًا لعدد من النباتات الأخرى من عائلة الباذنجانيات ، بما في ذلك. الأعشاب (ديلارد ، 1992). تصيب C. coccodes جميع الأجزاء الموجودة تحت الأرض من النبات ، وقواعد الساق ، والأوراق ، والثمار (Andrivon et al. ، 1998 ؛ Johnson ، 1994). على قشر درنات البطاطس المصابة ، لوحظ ظهور بقع رمادية ذات حواف واضحة بشكل غير واضح ، حيث تظهر بوضوح نقاط سوداء من الأبواغ و microsclerotia. أثناء التخزين ، قد تتكون قرح ذات محتويات مخففة في لب الدرنات ، أي يدخل المرض مرحلة الأنثراكنوز ، والتي ، مع ذلك ، نادرة للغاية.
في الوقت نفسه ، فإن أعراض الأنثراكنوز (تقرحات الجلد ذات النقاط السوداء الصغيرة) هي أعراض نموذجية على ثمار الطماطم. تظهر أعراض C. coccodes على الأوراق على شكل بقع بنية داكنة ، يحدها عادة نسيج أصفر (جونسون ، 1994).
يفسد ظهور البقعة السوداء على الدرنات مظهرها ، وهو ما يظهر بشكل خاص عند بيع البطاطس ذات القشرة الحمراء المغسولة. يؤدي تقشير التقشير إلى زيادة التبخر وزيادة خسائر التخزين (Hunger، McIntyre، 1979). يؤدي الضرر الذي يلحق بأعضاء النبات الأخرى إلى فقدان المحصول ، وهو ما لوحظ في كل من الأرض المفتوحة والمغلقة (جونسون ، 1994 ؛ تسور وآخرون ، 1999). الأمراض التي تسببها بكتيريا C. coccodes شائعة في جميع مناطق إنتاج البطاطس في العالم تقريبًا ، بما في ذلك روسيا (Leesa، Hilton، 2003؛ Belov et al، 2018). السيطرة على هذه الأمراض صعبة بسبب عدم فعالية المبيدات الفطرية الموجودة ضد C. coccodes ونقص الأصناف المقاومة (Read، Hide، 1995).
يمكن أن تستمر لقاح C. coccodes في درنات البذور (Read ، Hide ، 1988 ؛ Johnson et al. ، 1997) ، بذور الطماطم (Ben-Daniel et al. ، 2010) ، والتي تعيش لفترة طويلة في التربة ، على بقايا النبات (Dillard ، 1990 ؛ ديلارد ، كوب ، 1993) وفي الأعشاب (ريد ، بينيباكر ، 1987). أظهرت أعمال عدد من المؤلفين (Read، Hide، 1988؛ Barkdoll، Davis، 1992؛ Johnson et al.، 1997؛ Dillard، Cobb، 1993) أن تطور المرض في البطاطس والطماطم يعتمد إلى حد كبير على وجود لقاح في البذور و التربة. لذلك ، لتقليل الخسائر الناجمة عن المرض ، من الضروري تشخيص (بما في ذلك الكمي) انتشار الفطر في مادة البذور ، في التربة ، في درنات البطاطس البذور وبذور الطماطم الموضوعة للتخزين. لا يمكن إجراء التشخيص المورفولوجي في التربة والمواد النباتية إلا من خلال وجود التصلب المجهري ، والذي يوجد أيضًا في أنواع أخرى من الفطريات.
الأعراض الموجودة على الدرنات تشبه إلى حد بعيد القشرة الفضية التي يسببها فطر Helminthosporium solani. يعد عزل Colletotrichum coccodes و Helminthosporium solani في مزرعة نقية أمرًا صعبًا ويستغرق وقتًا طويلاً بسبب النمو البطيء على وسط غذائي. لتحديد coccodes Colletotrichum بسرعة ، من الضروري استخدام طرق التشخيص المفيدة. الطريقة الأكثر ملاءمة هي تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) وتعديله - في الوقت الحقيقي PCR. حاليًا ، يتم استخدام نظام اختبار طوره باحثون بريطانيون (Cullen et al. ، 2002) لمنطقة ITS1 من rDNA في أوروبا والولايات المتحدة. أظهر استخدامه نتائج جيدة في تحليل العزلات الروسية (Belov et al ، 2018). ومع ذلك ، فإن C. coccodes متغير بدرجة كبيرة ويمكن أن يؤدي اكتشافها من تسلسل DNA واحد إلى نتائج سلبية خاطئة. للحصول على تشخيص أكثر موثوقية ، يلزم إجراء تحليل للعديد من سلاسل الحمض النووي الخاصة بالأنواع ، والتي طورنا معها نظام اختبار أصلي يسمح بتحديد أكواد C. من خلال تسلسل جين نازعة الهيدروجين glyceraldehyde-3-phosphate.
المواد والأساليب
لتقييم فعالية وخصوصية أنظمة الاختبار التي تم إنشاؤها ، استخدمنا مزارع نقية من 15 نوعًا من الفطريات معزولة من قبل المؤلفين من عينات مريضة من أوراق الطماطم والفواكه ودرنات البطاطس (الجدول 1). للعزل ، تم أخذ أعضاء النباتات التي تظهر عليها أعراض عدوى فطرية ، ما لا يزيد عن عضو واحد لكل شجيرة.
تم وضع شريحة من درنة مع قشر وشريحة من فاكهة الطماطم وورقة مصابة تحت مجهر ثنائي العين ، وبعد ذلك تم نقل الفطريات أو الجراثيم أو قطعة من الأنسجة إلى وسط أجار (أجار نبتة) في طبق بتري بإبرة تشريح حادة. تم تخزين العزلات على مائل أجار في أنابيب اختبار عند 4 درجات مئوية.
تم وضع عينات من أوراق الطماطم لتحليلها مع أعراض الأمراض الفطرية مباشرة بعد الحصاد (في الحقل) في 70 ٪ من الكحول الإيثيلي حيث تم الاحتفاظ بها حتى عزل الحمض النووي. تم تسليم درنات البطاطس إلى المختبر ، وتم تقشيرها (قطعة 2 × 1 سم) منها ، وتم تجميدها عند درجة حرارة -20 درجة مئوية. تخزينها مجمدة حتى عزل الحمض النووي.
تمت زراعة الثقافات النقية للفطريات لعزل الحمض النووي في وسط البازلاء السائلة. تمت إزالة فطريات الفطر من الوسط السائل ، وتجفيفها على ورق ترشيح ، وتجميدها في نيتروجين سائل ، ومتجانس ، وحضنها في محلول CTAB ، وتنقيتها مع الكلوروفورم ، وترسبها بمزيج من الأيزوبروبانول و 0.5 مولار من أسيتات البوتاسيوم ، وغسلها مرتين باستخدام 2٪ كحول. تم إذابة الحمض النووي الناتج في الماء منزوع الأيونات وتخزينه عند -70 درجة مئوية (Kutuzova et al. ، 20). تم قياس تركيز الحمض النووي باستخدام مجموعة قياس HS DNA للحمض النووي المزدوج الذي تقطعت به السبل على Qubit 2017 (Qiagen ، ألمانيا). تم سحن العينات الكحولية والمجمدة في النيتروجين السائل ، ثم تم إجراء استخلاص الحمض النووي كما هو موصوف أعلاه (لميسليوم المزارع الفطرية النقية).
الجدول 1. أصل سلالات الفطريات المستخدمة
اسم الفطر | النبات ، الجهاز | مكان الاختيار |
---|---|---|
Colletotrichum coccodes 1 ، C. coccodes 2 ، C. coccodes 3 ، Ilyonectria crassa ، Rhizoctonia solani | درنة البطاطا | منطقة كوستروما ، درنات البطاطس من الجيل الأول ، الصنف الأحمر سكارليت |
رموز كوليتوتريتشوم 4 | أوراق البطاطس | اعادة \ عد. ماري إل ، يوشكار علا |
الديدان الطفيلية solani | درنة البطاطا | منطقة ماجادان ، نقاط البيع. خيمة ، درنة البطاطس |
كلادوسبوريوم فولفوم | أوراق الطماطم | منطقة موسكو ، طماطم كبيرة الثمار |
ألترناريا الطماطم | فاكهة الطماطم | تم تسليمها من قبل موظفي مختبر علم الفطريات وعلم الأمراض النباتية التابع لمعهد أبحاث عموم روسيا لوقاية النبات |
Fusarium verticillium ، Phomopsisphaseoli ، Alternaria alternata ، Phellinus ferrugineovelutinus ، Stemphylium vesicarium ، Cladosporium cladosporioides ، Acrodontium luzulae ، Penicillium sp. | فاكهة الطماطم | إقليم كراسنودار ، منطقة كريمسكي ، درجة كريم |
الفيوزاريوم أوكسيسبورم | جذر القمح | منطقة موسكو. |
تم إجراء PCR على مضخم DTprime (تقنية DNA). بالنسبة لـ PCR ، تم استخدام البادئات الأصلية ومسبار للمنطقة الخاصة بالأنواع الخاصة بجين الجلسرين ثلاثي الفوسفات ديهيدروجينيز: التمهيدي الأمامي Coc70gdf –TCATGATCATTTCTCTCACGGCA ، التمهيدي العكسي Coc280gdr - TACTTGAGCATGTAGGCCTGGGT1). تقوم البادئات بتضخيم منطقة 213 نقطة أساس.
أخذ التفاعل 50 نانوغرام من الحمض النووي الكلي (في تحليل الأوراق والدرنات) و 10 نانوغرام (في تحليل الحمض النووي للمزارع النقية للفطريات). تم فصل خليط التفاعل (35 ميكرولتر) بواسطة طبقة بارافين إلى جزأين: الجزء السفلي (20 ميكرولتر) يحتوي على 2 ميكرولتر من 10 × محلول تفاعل (750 ملي مولار Tris-HCl ، الرقم الهيدروجيني 8.8 ؛ 200 ملي مولار (NH4) 2SO4 ؛ 25 ملي مولار MgCl ؛ 2 ٪ توين- 0.1) ، 20 ملي مولار من كل ديوكسينوكليوتيد ثلاثي الفوسفات ، 0.5 بمول من كل أساس ، و 7 بمول من مسبار الفلورسنت القابل للتحلل بالماء ؛ يحتوي الجزء العلوي على 4 ميكرولتر من 1 × PCR و 10 U من Taq polymerase.
يسمح فصل الخليط بالبارافين بتخزين الأنابيب لفترة طويلة عند درجة حرارة 5 درجات مئوية ولتوفير بداية ساخنة لـ PCR بعد تسخينها لمدة 10 دقائق عند درجة حرارة أعلى من 80 درجة مئوية. تم إجراء PCR وفقًا للبرنامج التالي: 94.0 درجة مئوية - 90 ثانية (دورة واحدة) ؛ 1 درجة مئوية - 94.0 ثانية ؛ 30 درجة مئوية - 64.0 ثانية (15 دورات) ؛ 5 درجة مئوية - 94.0 ثوانٍ ؛ 10 درجة مئوية - 64.0 ثانية (15 دورة) ؛ 45 درجة مئوية - التخزين.
نتائج ومناقشة
تم تحديد تسلسل الجينات نازعة هيدروجين الجلسرين ثلاثي الفوسفات في 45 سلالة معزولة من الأوراق والسيقان ودرنات البطاطس وفواكه الطماطم (Kutuzova ، 2018) في مناطق مختلفة من روسيا. تم تقسيم التسلسلات التي تم فحصها لجميع السلالات إلى مجموعتين مختلفتين في نيوكليوتيدات. يتم إيداع تسلسل النوكليوتيدات لممثلي المجموعتين تحت الأرقام KY2 و KY496634 في GenBank.
تم فحص البادئات coc70gdf و coc280gdr ومسبار cocgdz المصمم على أساسها باستخدام برنامج BLAST (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) على جميع متواليات جين الجلسرين ثلاثي الفوسفات ديهيدروجينيز لأنواع من جنس Colletotrichum والكائنات الأخرى المتاحة في قاعدة بيانات GenBank.
لم يتم العثور على مناطق DNA للكائنات الأخرى شديدة التناظر مع البادئات والمسبار.
تم فحص حساسية نظام الاختبار باستخدام عينات ذات تركيزات مختلفة من الحمض النووي للكوكود ، والحمض النووي لأوراق البطاطس المصابة بأنثراكنوز (تم جمعها في عام 2017 في ماري إل ، متنوعة ريد سكارليت) ، وقشر الدرنات المصابة بالبقعة السوداء (تم جمعها في منطقة كوستروما ، متنوعة الأحمر سكارليت ، الجدول 2). لتأكيد وجود الحمض النووي في الدرنات وأوراق البطاطس ، تم عزل سلالات C. coccodes منها في مزارع نقية.
تظهر نتائج تحليل الحساسية لنظام الاختبار أنه يمكن استخدامه للتشخيص الناجح لوجود DNA coccodes في عينة إذا كان محتواها الإجمالي في خليط PCR أكثر من 0.05 نانوغرام. هذا كافٍ تمامًا للكشف ، حيث يحتوي أحد التصلب على متوسط 0.131 نانوغرام ، ويحتوي بوغ واحد على حوالي 0.04 نانوغرام من الحمض النووي (كولين وآخرون ، 2002). أظهر نظام الاختبار الذي طورته المجموعة الإنجليزية (Cullen et al. ، 2002) حساسية مماثلة (دورة العتبة 34 عند 0.05 نانوغرام من الحمض النووي و 37 عند 0.005 نانوغرام).
أتاح تحليل العينات الطبيعية المحتوية على C. coccodes في جميع الحالات إمكانية الكشف عن وجودها في العينة بشكل موثوق (الجدول 2). كانت الطريقة المقترحة لعزل الحمض النووي قابلة للتطبيق أيضًا في تحليل عينات النباتات الطبيعية.
الجدول 2. تحديد حساسية نظام الاختبار المقترح لتحديد الكودات Colletotrichum لـ PCR في الوقت الحقيقي
عينة | كمية الحمض النووي في العينة * ، نانوغرام | دورة العتبة | الكشف عن coccodes |
---|---|---|---|
Mycelium Colletotrichum coccodes | 50 | 21.3 | + |
5 | 25.7 | + | |
0.5 | 29,7 | + | |
0.05 | 33.5 | + | |
0.005 | 40 | - | |
0.0005 | 42.8 | - | |
0.00005 | - | ||
قشر الدرنات 1 | 50 | 32 | + |
قشر الدرنات 2 | 50 | 30 | + |
قشر الدرنات 3 | 50 | 31.5 | + |
ورق البطاطس | 50 | 29.5 | + |
ملحوظة. * في خليط من منتجات PCR.
تم اختبار خصوصية نظام الاختبار على عينات الحمض النووي المستخرجة من 15 نوعًا من الفطريات. تم عزل جميع سلالات الفطريات من قبل المؤلفين من ثمار وأوراق الطماطم ودرنات البطاطس المصابة والصحية. تم عزل سلالة واحدة من جذر القمح (الجدول 1). من بين الأنواع المعزولة من سطح الفاكهة ، هناك أيضًا أنواع غير مسببة للأمراض للطماطم (على سبيل المثال ، Phellinus ferrugineovelutinus).
أظهرت الدراسات أنه تم اكتشاف الحمض النووي لـ C. coccodes عند دورة عتبة 20-27 ، بينما لم يتم الكشف عن الأنواع الفطرية الأخرى أو أعطت إشارة بعد الدورة 40 ، والتي يمكن أن تُعزى إلى تأثير ضوضاء غير محدد (الجدول 3).
الجدول 3. اختبار نظام الاختبار لأنواع مختلفة من الفطر
اسم الفطر | دورة العتبة |
كوكودات كوليتوتريتشوم 1 | 20.9 |
ج. الكودات 2 | 22.6 |
ج. الكودات 3 | 23 |
ج. الكودات 4 | 22 |
الفيوزاريوم أوكسيسبورم | > 40 |
F. فرتيسيليوم | > 40 |
ريزوكتونيا سولاني | > 40 |
فوموبسيس فاسيولي | > 40 |
البديل البديل | > 40 |
أ. توماتوفيلا | > 40 |
الديدان الطفيلية solani | > 40 |
فيلينوس فيروجينوفيلوتينوس | > 40 |
ستيمفيليوم الحويصلة | > 40 |
إليونكتريا كراسا | > 40 |
كلادوسبوريوم كلادوسبوريويدس | > 40 |
C. فولفوم | > 40 |
أكرودونتيوم لوزولاي | > 40 |
البنسليوم س. | > 40 |
ملحوظة. * كانت كمية الحمض النووي في جميع العينات 10 نانوغرام.
تم استخدام نظام الاختبار المطور للتعرف على بكتيريا C. coccodes في عينات أوراق الطماطم مع أعراض مسببات الأمراض التنخرية ودرنات البطاطس بدون أعراض مرئية. للدراسة ، أخذنا درنات بذور من أصناف مختلفة تزرع في مناطق كوستروما وموسكو وكالوغا ونيجني نوفغورود. تم اعتبار وجود الحمض النووي لـ C. coccodes هامًا في العينات ، حيث لم تتجاوز دورة العتبة 35. تم اختيار هذه القيمة الحدية بناءً على التحديد الموثوق به لـ 0.05 نانوغرام من الحمض النووي لـ C. coccodes (دورة العتبة 33.5 ، الجدول 2) دورات عتبة أعلى من 40 ، تم تشخيص DNA غير محدد لبعض الأنواع الأخرى من الفطريات. مع هذا النهج ، تم الكشف عن وجود كبير للحمض النووي coccodes في 5 عينات من الدرنات المزروعة في مناطق كوستروما ، موسكو ، كالوغا وفي ورقة طماطم واحدة من منطقة Yeisk في منطقة كراسنودار (الجدولان 4 ، 5).
الجدول 4. الكشف عن الكودات Colletotrichum على درنات البطاطس *
رقم العينة | مجموعة متنوعة من البطاطس | مكان النمو | الكشف عن coccodes | دورة العتبة |
---|---|---|---|---|
1 | الأحمر القرمزي | منطقة كوستروما | + | 35 |
2 | + | 35 | ||
3 | - | 38 | ||
4 | سانتي | منطقة موسكو. | + | 34 |
5 | - | |||
6 | - | 41 | ||
7 | - | 41.8 | ||
8 | + | 30 | ||
9 | جوكوفسكي في وقت مبكر | منطقة موسكو. | - | 40.5 |
10 | - | 40.6 | ||
11 | - | |||
12 | مولي | منطقة كالوغا | + | 34.3 |
13 | - | 38.4 | ||
14 | خيال | منطقة كالوغا | - | |
15 | مهرجان | منطقة نيجني نوفغورود. | - | |
16 | - |
ملحوظة. * كانت كمية الحمض النووي في جميع العينات 50 نانوغرام.
الجدول 5. الكشف عن كوليتوتريشوم كوكود على أوراق الطماطم *
رقم العينة | مكان النمو | الكشف عن coccodes | دورة العتبة |
---|---|---|---|
1 | إقليم كراسنودار ، منطقة القرم | - | |
2 | - | ||
3 | - | ||
4 | - | 45 | |
5 | - | ||
6 | - | ||
7 | - | ||
8 | - | ||
9 | إقليم كراسنودار ، منطقة يسك | - | 39.2 |
10 | - | 40.8 | |
11 | - | ||
12 | - | 41.6 | |
13 | - | 40 | |
14 | - | 41 | |
15 | - | 41.9 | |
16 | - | ||
17 | - | ||
18 | - | 40.3 | |
19 | - | ||
20 | - | ||
21 | + | 34.5 | |
22 | - | ||
23 | - |
* كانت كمية الحمض النووي في جميع العينات 50 نانوغرام.
إن نظام الاختبار الذي أنشأناه ليس أدنى من ذلك الذي طوره باحثون بريطانيون (كولين وآخرون ، 2002) في الحساسية والنوعية وهو مناسب لتحليل عينات النباتات. إن تطبيقه لتحليل درنات البذور جعل من الممكن التعرف على DNA coccodes DNA في الدرنات بدون علامات خارجية للضرر ولتحليل إصابة الأوراق بنجاح.
حتى الآن ، لم يتم إجراء أي تحليل لدرنات البطاطس لإصابة C. coccodes في روسيا. أظهرت دراستنا الأولى أنه من بين 16 درنات بذرة مختبرة نمت في مناطق مختلفة من الاتحاد الروسي ، 5 منها تحتوي على بكتيريا C. coccodes. هذا يدل على أن البقعة السوداء لدرنات البطاطس هي مرض شائع للبطاطس في روسيا ، ودورها في تقليل حجم ونوعية محصول البطاطس لا يتم تقديره.
أظهر تحليل أوراق الطماطم وجودًا مهمًا لدنا DNA coccodes في ورقة واحدة من منطقة Yeisk في إقليم كراسنودار. في وقت سابق ، عند فحص حقول الطماطم في جنوب روسيا باستخدام نظام الاختبار البريطاني (Cullen et al. ، 2002) ، تم العثور على أوراق تحتوي على C. coccodes ، وفي بعض الحقول تم العثور على نسبة عالية من الأوراق المصابة بـ C. coccodes (Belov et al.، 2018). في إقليمي كراسنودار وبريمورسكي ، منطقة موسكو ، وجدنا ثمار الطماطم ، والتي تمكنا من عزل الثقافات النقية من بكتيريا C. من المحتمل أن يكون بكتيريا C. coccodes أكثر انتشارًا على الطماطم في روسيا مما يُعتقد الآن ، كما يتم التقليل من ضررها.
وهكذا ، حتى الآن ، تم تجميع معلومات كافية حول التوزيع الواسع النطاق لـ C. coccodes على البطاطس والطماطم.
لفهم دور هذه الفطريات بشكل أفضل في تطور أمراض البطاطس والطماطم ، من الضروري مراقبة انتشارها في روسيا ، ودراسة دور التهابات التربة والبذور ، ودور البقعة السوداء في الخسائر أثناء التخزين. يمكن أن يؤدي استخدام تشخيصات PCR إلى تسهيل هذا العمل بشكل كبير ، وسيؤدي الاستخدام المتزامن لكلا نظامي الاختبار إلى زيادة دقة التحليل بشكل كبير.
تم دعم هذا العمل بمنحة من مؤسسة العلوم الروسية رقم 18-76-00009.
نُشر المقال في مجلة Mycology and Phytopathology (المجلد 54 ، العدد 1 ، 2020).